平安时代末，天灾人祸，世道离乱，横尸遍野。在这个人吃人的恐怖时代，一条受到诅咒的生命降临人间。年幼的他（野泽雅子 配音）自幼以人肉为食，成为令人闻风丧胆的食人魔。直到与慈悲的法师（北大路欣也 配音），他才终于有了名字“阿修罗”，一句“南无阿弥陀佛”更在阿修罗的心中种下人性复苏的种子。在被人追杀的绝望途中，阿修罗得到美丽少女若狭（林原惠美 配音）给他无微不至的关怀与照顾，野兽般少年的心底善良的花...

　　现在，全世界所有人都在使用的智能手机App。　　那里潜藏着无人知晓的存在·Applimonster，通称“Appmon”。　　Appmon是具备能够自主思考行动的人工智能的App生命体，　　在人类世界与数码空间的间隙中，为系统及人类发挥着机能。　　但，潜藏在网络之海中的“凶恶的最终BOSS人工智能·利维坦”　　化作病毒控制了Appmon们，并开始黑入各个系统，　　企图从网络一侧控制人类的世界。...

　　以成为神奇宝贝大师为目标，小智（松本梨香 配音）、小刚（うえだゆうじ 配音）和小光（豊口めぐみ 配音）带着各自的神奇宝贝在世界各地进行艰苦的修业之旅，今天他们历经长途跋涉终于来到了风景秀美的米琪亚镇。在当地一对小兄妹的介绍下，小智一行前往神殿遗址游玩。谁知却遭遇了极其危险的情况。关键时刻，掌管时间的迪亚鲁加和守卫神殿的西娜（北乃きい 配音）、凯宾（岸祐二 配音）帮助了他们，能与神奇宝贝心灵沟通...